平成24年度（第16回）文化庁メディア芸術祭実行委員会では、メディア芸術祭賞（文部科学大臣賞）の受賞作品・受賞者が決定した。
本年度の応募は昨年の2714作品を大きく上回り、過去最多となる海外71カ国と地域からの1502作品を含む、合計3503作品。厳正なる審査の結果、部門ごとに、大賞1作品、優秀賞4作品、新人賞3作品を、功労賞としてメディア芸術分野に貢献のあった 4名を選出した。2013年2月12日に贈呈式が行われる。
また2月13日～24日には、国立新美術館（東京・六本木）をメイン会場に、受賞作品等を紹介する受賞作品展を開催。会期中は作品の展示・上映のほか、受賞者によるプレゼンテーションやシンポジウム等を実施する。
アート部門
大賞
『Pendulum Choir』Cod.Act (Michel DECOSTERD / Andre DECOSTERD)
優秀賞
『欲望のコード』三上晴子
『BETWEEN YESTERDAY & TOMORROW』SOL CHORD（前 真二郎／岡澤理奈）
『Bye Buy』Neil BRYANT
『On Pause』Mikhail ZHELEZNIKOV
新人賞
『Outback and Beyond』Grayson COOKE / Mike COOPER
『Species series』YANG Wonbin
『Strata #4』Quayola
エンターテインメント部門
大賞
『Perfume “Global Site Project”』
真鍋 大度／MIKIKO／中田 ヤスタカ／堀井 哲史／木村 浩康
優秀賞
『あさっての森』三木 俊一郎
『勝手に入るゴミ箱』倉田 稔
『水道橋重工「KURATAS」』倉田 光吾郎／吉崎 航
『GRAVITY DAZE/ 重力的眩暈：上層への帰還において、彼女の内宇宙に生じた摂動』
外山 圭一郎（GRAVITY DAZEチーム）
新人賞
『どうでもいいね！』IDPW
『永野 亮「はじめよう」』新井 風愉
『ハイスイノナサ「地下鉄の動態」』大西 景太
アニメーション部門
大賞
『火要鎮』大友克洋
優秀賞
『アシュラ』ジョージ 秋山／さとう けいいち
『おおかみこどもの雨と雪』細田守
『グレートラビット』和田淳
『グスコーブドリの伝記』杉井ギサブロー
新人賞
『布団』水尻自子
『LUPIN the Third ～峰不二子という女～』モンキー・パンチ／山本沙代
『Oh Willy…』Emma De SWAEF／Marc James ROELS
マンガ部門
大賞
『闇の国々』ブノワ・ペータース／フランソワ・スクイテン 訳：古永真一／原正人
優秀賞
『岳 みんなの山』石塚 真一
『ましろのおと』羅川 真里茂
『ムチャチョ ある少年の革命』エマニュエル・ルパージュ
『GUNSLINGER GIRL』相田 裕
新人賞
『凍りの掌 シベリア抑留記』おざわゆき
『千年万年りんごの子』田中相
『ぼくらのフンカ祭』真造圭伍
功労賞
佐藤茂（音響技術者）
江並直美（電子出版物プロデューサー）
大河原邦男（メカニックデザイナー）
小長井信昌（編集者）
※このほか、優れた122作品を審査委員会推薦作品として選定
